數(shù)年前，人類以級(jí)戰(zhàn)艦“轟天號(hào)，在南極擊潰“吉拉”，并且將哥吉拉”封印在底下。但是地球了“哥吉拉”以，還有許許多多怪獸，對(duì)各大人都市虎視眈眈。是，人類成立了地球防衛(wèi)部”，門對(duì)付各種怪獸入侵。而地球防部最強(qiáng)大的成員就是當(dāng)年封印哥拉的“轟天號(hào)”及其艦長“道格斯·戈登上校”                                                                    此外，為了應(yīng)付怪宋書人類造成的困擾地球防衛(wèi)部特別選了有特殊能力人類，這些“超類”擁有普通人所沒有的“M染色體”，讓這些人擁有比普通人更大的體能跟敏捷，以應(yīng)付怪獸的擊，其中的佼佼就是“尾崎真一尉”。                                                                    就在不久之前，人們廆山到一個(gè)巨怪物的遺骸，而怪物擁有機(jī)械跟物的本質(zhì)，懷疑夠?qū)⑸锔鷻C(jī)械合起來的怪物應(yīng)來自于外太空。久，尾崎真一收來自嬰兒島“小人”的警告，這怪物是當(dāng)年被“斯拉”給封印的蓋剛”，蓋剛的現(xiàn)代表著人類的機(jī)。                                                                    就在蓋剛出土不，世界各地突然同一時(shí)間，遭受了各大怪物的攻，一時(shí)之間讓地防衛(wèi)部忙的焦頭額。但是突然出的神秘飛行器，將這些怪物全部帶走。這些自稱X星人”的外星來訪客，聲明自己人類的朋友，要人類建立起同盟系，更聲稱有一巨大的星球即將上地球。但是在崎真一還有道格斯等人的調(diào)查之，發(fā)現(xiàn)根本就沒神秘星球要撞擊球。而那些怪獸本就是外星人侵地球所釋放的，X星人根本是要把類當(dāng)作糧食來利。                                                                    雖然外星人的真面被揭穿，但是外人擁有不可思議超能力，還有手聽命于外星人的大怪物。地球防軍最后被殲滅，剩下轟天號(hào)還茍殘喘著。此時(shí)，格拉斯想出一個(gè)膽的計(jì)策，就是開南極哥吉拉的印，讓代表地球強(qiáng)大怪物的哥吉，去面對(duì)這些外來的侵略者....