在代歐奇斯（以下歐）變成御型態(tài)與空坐持續(xù)戰(zhàn)的同時拉魯斯市播系統(tǒng)昭大家緊急難。市民聽到廣播便驚慌疏。代歐此又變成攻型態(tài)，并裂空坐釋攻擊。廣持續(xù)呼吁眾這并非習，而小則在逃竄的人群當，大惑不為何代歐活著。當超在避難遇見一只過的正電拍。小超看到神奇貝頓時嚇了，但聽它的求救便鎮(zhèn)靜下。原來它同伴負電拍被陷進圾桶里無掙脫，小決定幫忙當他打開圾桶蓋時忽然負電拍迫不及地沖出來小超又嚇了，不由主地想要離現(xiàn)場，時忽然小比獸也從圾桶冒出！可憐的超就這么過去了。后小智趕發(fā)現(xiàn)不省事的小超便用盡方想把小超醒。小超醒后卻不興地嫌小多管閑事背景的小比獸則撿垃圾吃）此時小遙小剛、正、阿隆、位女性和位雙胞胎生也趕到而小智正促小超趕逃難。但超還來不動作，忽一束死光到他們附的地面，大家嚇得飛魄散！家驚魂甫時，小超知有個地可以躲難一行人便了過去。 小超帶大來到他之去的玻璃室植物園當小超對物園的入讀卡機刷時，發(fā)現(xiàn)卡機故障門打不開。正太自奮勇地用手奮力把扳開。當家為正太采時，阿盯著小智，輕蔑地小智怎么待在拉魯市里，以他慘敗后該羞愧地老家了。智生氣地要再跟他一場，小只得勸架現(xiàn)在不是機，但這一旁的兩雙胞胎女加油添醋說她們的哥絕不會給小智。智質(zhì)問她是誰，而位女性解那兩位小生是正太妹妹們，オドリ（：大鳥）キャサリ（暫：凱琳）。女則自我介是ヒトミ暫：小瞳。接下來們都知道剛會做出么反應啦而小勝也刻拉走小的耳朵。 之后阿隆大家該如在植物園打發(fā)時間而小瞳則出筆記型腦開始查那只DNA神奇寶貝資料。但乎她意料外并沒有何代歐的料，正太催促她繼嘗試（背的小卡比正在睡覺。此時小詢問一臉傷的小超么了，而其他人的切下，小開始訴說四年前的歷。小超望著還在戰(zhàn)的兩只奇寶貝，大家（除小卡比獸的全神貫下，說代是從宇宙的。四年一顆隕石中地表，從隕石中迸出那只倫多博士名為“代奇希斯”神奇寶貝由于它侵了裂空坐大氣層領，于是大戰(zhàn)開始。空坐的破死光之后準地轟碎歐奇希斯成為零星片。阿隆小超的故懷疑并嗤以鼻，而太也叫小別把他們小孩騙，反問為何歐現(xiàn)在還著？小超能回答他知道。 此時在溫室物園上空代歐開始制自己的影子代歐分身。分群一看到處躲藏的慌市民，然就開始下來，擄市民到不名的地方了！ 在植物園中小他們?nèi)越?小瞳的電收聽廣播記者播報在拉魯斯被?\罩在代歐所形的透明罩無法對外行，并且子代歐們仍不停地走人們。瞳關掉電，正太則心被困在里。在窗的影子代群不時地近，把大和凱薩琳哭了。忽一只分身破玻璃屋進來，小看到趕緊大家趕快，但影子歐卻已經(jīng)下來了！太叫出水龜用高壓浦，卻對子代歐無。就在正納 悶為何無效的時，從背后一只影子歐偷襲正和水箭龜從屋頂破把他們擄了！阿隆氣地叫出焰雞使出焰飛踢，智叫皮卡用十萬伏，小瞳叫巨金怪用星拳，雙胎叫出溜糖球和雨蛾用泡沫線。這些奇寶貝在付影子代群時，小叫大家趕逃走，阿則問小超否知道緊出口在哪突然小剛現(xiàn)他的寶球無法打了，其他也驚覺他的也不行 影子代歐又殺出重逼近小超害他只好續(xù)逃躲。隆叫火焰攻擊影子歐，并叫家別管他先行逃離阿隆請小照顧好他兩個妹妹但小遙不丟下阿隆管。此時剛正著急想叫醒小比獸（居到這節(jié)骨還在睡）而火焰雞續(xù)使出上拳拖延時，讓小遙們有時間到出口。遙叫正在斗的小智們趕快跑來，但小他們還是咐小遙她先行離開忽然，小比獸打了大的呵欠同時嘴里出白光照整個溫室居然把所影子代歐光分解了小智他們趁機跑向口離開。 此時在倫博士的研實驗室里倫多博士省人事地平。助手野手持電棒，嘴里惺惺地感倫多博士努力帶給不少的方，忘我地著水晶球，幻想自能如何地中獲得暴和權勢并起神奇寶界的大革。這時忽有人敲門春野嚇了跳。原來面是小超一行人，超則對一人解釋實室是建造植物園的下。春野時開門讓家進去，實驗室里不見倫多士的人影小超問春父親的下，春野騙倫多博士經(jīng)出門找了。小超心外面那危險爸爸不會有事春野則叫超不要窮心。小智算出去尋博士，但隆則叫小不要貿(mào)然動造成大的擔心。群人便待一起等倫博士回來 已經(jīng)晚上了，卻仍見倫多博的蹤影。鳥和凱薩一直喊累餓，阿隆好哄她們靜再等一。此時小比獸手拿三明治走大鳥和凱琳，那對胞胎以為只好心的奇寶貝帶她們食物卻看到小比獸當面三明治吞了！兩個生頓時大，小智則定要出外食物。阿仍是提醒智外面的險，但這小智毅然跑出去，隆和其他只好尾隨 在外頭可看到影子歐四處飄，如同在邏一般。智他們放姿態(tài)以免發(fā)現(xiàn)，并起計畫找食物大作。當影子歐暫時離后大伙便頭行進，小智、皮丘和小剛到了一臺狗販賣機但電源切了。小智皮卡丘使十萬伏特那臺電動賣機便一啟動一邊放音樂，狗不停地出來，小他們就盡能地抓了大把。忽，小剛把智壓在地，并叫他要出聲，來頭頂上著一群影代歐。小他們躲在賣機后面但機器的樂卻還在放！影子歐聽到音后往販賣逼近，小他們則嚇以為死定。忽然小和正、負拍拍從另頭走出來完全不知影子代歐存在。分們立刻沖小超，但、負電拍聯(lián)合用了擊絕招保小超。這，一只影代歐倏地住負電拍和小超！智便奮不身地抓住只分身并咬它的一手臂，小便掙脫成了。小智小超是否然無恙，卡丘則持攻擊其他身。但為實在太多，小智叫家趕快逃，但小超擔心負電拍的安全小剛呼吁們自身的全更重要于是他們逃離現(xiàn)場。他們來一間開著戶的建筑，于是便進窗戶躲。影子代群飛掠過，幸好沒發(fā)現(xiàn)小智們的蹤跡在稍微喘后，小超現(xiàn)正電拍為它的同難過，便著撫摸安正電拍拍卻因為幼創(chuàng)傷的身排斥反應他無法這做，只好正電拍拍歉。此時卡丘在這建筑里找一瓶水，大家心情了起來。 之后大家了一番力回到實驗，并一面著熱狗一稱贊多好。此時阿指著小瞳電腦廣播告訴小智些被影子歐擄走的們（包括箭隊…和達鴨）都帶到不知的地方。剛對那個定地方感奇怪，這忽然聽到多博士的音！原來從柜子里沈地爬出，顯然不道自己被昏的事情博士說代正在找它朋友，并大家春野哪里。大說春野出了，博士顧四周發(fā)水晶球體見了。小問父親那什么，倫博士則回，那球體代歐奇希的另一部身體。之博士透露來那球體是讓代歐生、復制關鍵！小告知春野著球體離了，阿隆猜測原來歐就是為找回這球才返回攻大家的。 忽然，之在植物園的神秘光又出現(xiàn)在超面前和“談話”小超向大介紹這是在植物園識的朋友之后那光形成另一代歐奇希的身影。超告訴父或許水晶體還有生，便沖出尋找，后跟著其他。 此時在拉魯斯市偏僻處，野帶著一箱子瘋狂跑。忽然兩只神寶戰(zhàn)斗中射一束死光在附近的面爆炸讓野失去重并摔倒箱滾出水晶體。爆炸發(fā)的碎石始落向春，而這倫博士的助就被掩埋。在天空的兩只神寶貝也沒著，裂空開始用身緊纏代歐讓代歐無動彈。 小超后頭跟其他人，由那個光的帶領下續(xù)向前跑小超現(xiàn)在解為何代奇希斯不要孤獨，感同身受決定要成代歐的朋。其他人決定幫助超停息裂坐與代歐爭。此時野掙脫瓦堆，一邊罵水晶球帶來他的煩。春野時困惑地尋水晶球的下落，立刻信誓旦地自信定能很快到。他拿遙控器按鈕，激發(fā)遠處的水球體射出光。在天中，被裂坐纏住的歐往下看晶體，臉頓時露出怒的表情回到地上引導小超光芒正往晶球體發(fā)的強光接，小智則高采烈地找到了。隆覺得奇為何水晶體會發(fā)出光，大家蹲下來端。此時春出現(xiàn)說水球體是他，并伸手備拿的時，一群影代歐過來春野包圍了。阿隆為它們也要來拿水球體，此小智決定這次要幫春野…！